Ich würde mal davon ausgehen, dass der TV sämtliche Formate versteht, welche auch iTunes/QuickTime verarbeiten kann.
Wenn er mit iOS läuft, könnte das für mache Kraut & Rüben download Freaks nicht reichen, aber die haben deshalb schon heute keine Apple TV Box. Einen Streaming Client, der wirklich alle Formate sauber beherrscht, wird es wohl nie geben. Da kommt einfach zu schnell, zu viele neue dazu...
Auf OS X ist das ja kein Problem. Da installiert man sich halt noch Perian und Flip4Mac dazu, und gut ist. Wer's unbedingt braucht, halt auch noch Flash oder Silverlight (mit Blocker für punktuelle Aktivierung wenn nötig).
Die separaten Plugins von Real oder Divx habe ich schon länger deinstalliert, und bisher nie vermisst.
Silverlight brauchte ich zum Glück nie, und Flash wird dank HTML5 hoffentlich auch bald überflüssig sein. Durch die Hintertüre lasse ich auch kein als Air verpacktes Flash rein.